Τα ζιζάνια ανταγωνίζονται το βαμβάκι για το φως, το νερό και τα θρεπτικά συστατικά, μειώνοντας σημαντικά τις αποδόσεις και τη ποιότητα τους. Το μέγεθος της ζημιάς εξαρτάται από τη διάρκεια παραμονής των ζιζανίων στον αγρό και το στάδιο ανάπτυξης των βαμβακόφυτων. Στις πρώτες εβδομάδες από τη σπορά, τα φυτά έχουν αργή ανάπτυξη και δεν είναι ανταγωνιστικά έναντι των ζιζανίων, αντίθετα, ζιζάνια που εμφανίζονται στον αγρό σε μετέπειτα στάδια ανάπτυξης δεν επιδρούν στην τελική απόδοση.
Για τη διαχείριση των ζιζανίων εφαρμόζεται μηχανικό σκάλισμα, με το οποίο επιτυγχάνεται, παράλληλα, αναμόχλευση του επιφανειακού στρώματος εδάφους και σπάσιμο της «κρόυστας» που μπορεί να είχε δημιουργηθεί από τις βροχές. Για τα ζιζάνια που εμφανίζονται επί της γραμμής σποράς, μπορεί να εφαρμοστεί χειρονακτική καταστροφή με τσάπα, που είναι μια ιδιαίτερα επίπονη διαδικασία και αυξάνει το κόστος παραγωγής, και μεταφυτρωτικά ζιζανιοκτόνα.
Σύμφωνα με το ΔΑΟΚ Σερρών, τα μεταφυτρωτικά ζιζανιοκτόνα που εφαρμόζονται είναι:
Staple (pyrithiobac sodium 94%) 18 κυβ. εκατ. σκευάσματος το στρέμμα
Εnvoke 75w (tricyfloxysulfuron) 1,5 - 2 γρ. σκευάσματος το στρέμμα
Τα δυο μεταφυτρωτικά ζιζανιοκτόνα θα είναι διαθέσιμα αν λάβουν, όπως τα προηγούμενα χρόνια, άδεια παρέκκλισης 120 ημερών· και ελέγχουν ετήσια αγρωστώδη και πλατύφυλλα ζιζάνια.
Παπακώστα- Τασοπούλου Δ., 2013 Βιομηχανικά Φυτά, Θεσσαλονίκη: Εκδόσεις Σύγχρονη Παιδεία σελίδες 81-83
Ενημερωτικό υλικό «Βασικές οδηγίες καλλιέργειας Βαμβακιού» από Διεύθυνση Αγροτικής Οικονομίας και Κτηνιατρικής Σερρών
