Από το 2018 μέχρι και το 2024 ο Κώστας Κουτσουμανής ήταν Πρόεδρος της επιτροπής Βιολογικών κινδύνων. Από το 2018 ήταν μέλος της ομάδας Joint FAO/WHO Expert Meetingon Microbiological Risk Assessment (JEMRA).
Ως επιστημονικός υπεύθυνος είχε λάβει χρηματοδοτήσεις άνω των 5 εκατομυρίων ευρώ από ευρωπαϊκά και εθνικά προγράμματα. Τα ερευνητικά του ενδιαφέροντα περιλαμβάνουν την μελέτη και βελτίωση της μικροβιολογικής ποιότητας και ασφάλειας των τροφίμων, την ανάπτυξη εργαλείων ποσοτικής μικροβιολογίας (μαθηματικά μοντέλα) και προσδιορισμού επικινδυνότητας, την ανάπτυξη στοχαστικών προσεγγίσεων στην ποιότητα και ασφάλεια των τροφίμων, την ανάπτυξη και εφαρμογή χρονο-θερμοκρασιακών δεικτών και καινοτόμων συσκευασιών των τροφίμων κλπ.
Τα αποτελέσματα της έρευνάς του έχουν δημοσιευθεί σε περισσότερες από 250 ερευνητικές εργασίες σε διεθνή επιστημονικά περιοδικά του SCI, 15 κεφάλαια σε βιβλία και 150 πρακτικά επιστημονικών συνεδρίων ενώ το δημοσιευμένο έργο του έχει περισσότερες από 13500 αναφορές και δείκτη h=65.
